Baguena se ubica en el valle del Jiloca, con su casco urbano dispuesto alrededor de dos colinas en la margen derecha del río. Sobre una de ellas se pueden ver los restos de su castillo medieval, célebre en 1363 por la resistencia que opuso, siendo alcadlde Miguel de Bernabe, a las tropas del rey Pedro I de Castilla durante la guerra de los dos Pedros. El origen del pueblo se sitúa en “El Vayo” donde hubo un castillo de la Orden del Temple, alrededor del cual surgió la localidad.
Además de varias edificaciones de tipo renacentista aragonés del siglo XVI dispersas por el tramado urbano destaca, a la orilla de la antigua carretera nacional de Valencia-Burgos, la iglesia parroquial.
El edificio está construido a base de mampostería y piedra sillar, pudiendo datar su primitiva fábrica a principios del siglo XV, ya que en un documento de 1409, exhumado por Isaac Bureta Anento, se nombra a Pascual de Exulve que recibe unas cantidades de dinero por la construcción de dos capillas, dos pilares y un arco. La capitulación se habría llevado a cabo en 1403, época del Papa Benedicto XIII, cuyo escudo aparece en un lateral de la clave de la bóveda que cubre la estancia del primer cuerpo de la torre, por lo que es de suponer que la obra contase con su mecenazgo.